植物分子发育生理研究组组长、中国科学院大学教授。NSFC国家杰出青年获得者、NSFC“细胞分化与器官发生”创新群体首席科学家、“百千万人才工程”国家级人选。中国植物学会理事长、中科院植物所学术委员会主任。担任Journal of Integrative Plant Biology共同主编，Journal of Biological Chemistry、Molecular Genetics and Genomics、Journal of Genetics and Genomics编委。
主持承担多项重大研究项目，如中科院战略性先导专项、科技部973和863项目等。在Cell、Annual Review of Plant Biology、Nature Plants、Nature Communications、Molecular Cell、Developmental Cell、Cell Reports、EMBO Journal、PNAS、Genome Biology和The Plant Cell等学术期刊发表研究论文100余篇。多次获得中国科学院优秀教师奖励。已培养硕士和博士70余名、博士后7名，其中多名博士生获得“中国科学院优秀博士论文”奖励和中国科学院院长优秀奖。
曾获得2015年度中国生命科学领域十大进展奖、2020年中国植物生理与植物分子生物学学会杰出成就奖、2021年度何梁何利基金科学与技术进步奖等诸多奖项。
植物分子发育生理
1. 水稻感受低温信号网络与分子设计
发现水稻低温感受复合物及其信号网络，揭示了耐寒性关键基因起源于中国野生稻；通过功能基因组等组学研究，发现了多个基因对水稻耐逆与生长发育的调控，为水稻耐寒分子设计育种奠定理论基础。
2. 苜蓿耐逆性状分子设计
基于紫花苜蓿的基因组自然变异，通过表型组学、基因组学等多组学手段，挖掘苜蓿耐逆基因和功能模块；利用现代分子生物学技术，开展苜蓿耐逆功能基因的解析，构建苜蓿耐逆调控网络，为创制耐逆苜蓿新材料提供候选分子模块。
3. 小麦春化分子机理
发现小麦感知春化控制开花的机制，揭示蛋白质糖基化和磷酸化修饰和非编码RNA表观遗传网络。
主持和参加的科研项目：
1] “创建生态草牧业科技体系”， 中国科学院A类先导专项（2019.11-2024.10）；专项负责人
[2] “作物温度信号感受与应答的蛋白质机器研究”， 国家重点研发计划项目（2020.12-2025.11）；项目负责人
[3] “种子精准设计的分子基础”， 中国科学院先导A项目（2019.11-2024.10）；项目负责人
[4] “未来作物分子设计”， 国家自然科学基金科学中心项目（2018.01-2022.12）；课题负责人
Feng JL, Li ZT, Luo W, Liang GH, Xu YY, Chong K*. 2023. COG2 negatively regulates chilling tolerance through cell wall components altered in rice. Theor Appl Genet. 136:1-11.
Guo XY#, Zhang DJ#, Wang ZL, Xu SJ, Batisti O, Steinhorst L, Li H, Weng YX, Ren DT, Kudla J, Xu YY, Chong K*. 2023. Cold-induced calreticulin OsCRT3 conformational changes promote OsCIPK7 binding and temperature sensing in rice. EMBO J, 42:e110518.
Li ZT#, Wang B#, Luo W, Xu YT, Wang J, Xue ZH, Niu YD, Cheng ZK, Ge S, Zhang W, Zhang JY*, Li QZ*, Chong K*. 2023. Natural variation of codon repeats in COLD11 endows rice with chilling resilience. Sci Adv. 9(1):eabq5506
Xiao J*, Liu B, Yao Y, Guo Z, Jia H, Kong L, Zhang A, Ma W, Ni Z, Xu S, Lu F, Jiao Y, Yang W, Lin X, Sun S, Lu Z, Gao L, Zhao G, Cao S, Chen Q, Zhang K, Wang M, Wang M, Hu Z, Guo W, Li G, Ma X, Li J, Han F, Fu X, Ma Z, Wang DW*, Zhang XY*, Ling HQ*, Xia GM*, Tong YP*, Liu ZY*, He ZH*, Jia JZ*, Chong K*. 2022. Wheat genomic study for genetic improvement of traits in China. Sci China Life Sci. 65:1718-1775.
Li JH, Zhang ZY, Chong K, Xu YY*. 2022. Chilling tolerance in rice: Past and present. J Plant Physiol. 268:153576.
Luo W, Huan Q, Xu YY, Qian WF, Chong K*, Zhang JY*. 2021. Integrated global analysis reveals a vitamin E-vitamin K1 sub-network, downstream of COLD1, underlying rice chilling tolerance divergence. Cell Reports, 36(3):58-76.
Yang WS, Wu K, Wang B, Liu HH, Guo SY, Guo XY, Luo W, Sun SY, Ouyang YD, Fu XD, Chong K, Zhang QF*, Xu YY*. 2021. The RING E3 ligase CLG1 targets GS3 for degradation via the endosome pathway to determine grain size in rice. Molecular Plant, 14(10):1699-1713.
